В Генетике, Каков Метод Дробовика?
Метод дробовика используется, чтобы упорядочить длинную проволоку дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) молекула. Это полагается на другой метод секвенирования ДНК, названного методом обрыва цепи. С методом дробовика, частями последовательности ученых нити ДНК и использования результаты создать непрерывную последовательность.
Секвенирование является процессом обнаружения атомного состава молекулы и исследования химических связей, которые объединяют те атомы. В ДНК секвенирование используется, чтобы найти заказ, в котором происходят определенные молекулы. Эти молекулы называют нуклеотидами. Четыре основания нуклеотида - аденин, 2-амино-6-оксипурин, 2-окси-6-аминопиримидин, и тимин.
Один способ секвенирования длинная проволока ДНК при использовании метода дробовика. В этом методе ДНК разбита в случайные фрагменты. Получающиеся сегменты тогда упорядочены, используя метод, названный методом обрыва цепи. Обрыв цепи - предпочтительный метод для краткости последовательности ДНК. Это использует немного грубых химикатов и более низкого количества радиоактивности чем другие короткие методы последовательности.
В методе обрыва цепи проволока ДНК разделена на четыре реакции секвенирования. Каждый содержит все четыре нуклеотида и фермент что действия как катализатор, названный полимеразой ДНК. dideoxynucleotide, который является в основном нуклеотидом недостающая часть его сахарной последовательности, тогда добавлен к каждой реакции секвенирования. После обработки этих реакций ученые в состоянии к изображению их и читают последовательность ДНК.
Во время метода дробовика ДНК секвенирования все это происходит, несколько раз используя различные случайные фрагменты ДНК. Это приводит к многократным разделам перекрывания упорядоченной ДНК. Компьютерная программа тогда использует накладывающиеся секции, чтобы создать непрерывную последовательность ДНК.
проблема с методом дробовика - то, что ДНК невероятно сложна. Часто, это содержит повторные последовательности, которые выглядят одинаково, но прибывают различные части формы ДНК. У полного комплекта человеческой ДНК, названной человеческим геномом, есть больше чем три миллиарда пар азотистых оснований. Единственный способ убедиться, что размещение повторных последовательностей правильно, состоит в том, чтобы сделать более случайные чтения так, чтобы каждая часть была упорядочена многократно. Даже в этом случае, ошибки происходят.
Метод дробовика секвенирования был передним краем секвенирования ДНК приблизительно до 2005. С тех пор, ученые создали секвенирование следующего поколения, которое работает намного быстрее. Точность отдельных чтений - меньше чем с секвенированием дробовика, но ученым компенсирует это возможность сделать больше чтений скорее.